食用菌的菌種制作是食用菌栽培的前提，純度高生命力強的菌種是食用菌栽培取得豐產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的先決條件。菌種質(zhì)量的好壞不僅關(guān)系到一個種菌場的經(jīng)濟效益高低和信譽好壞，而且關(guān)系到廣大菇農(nóng)的栽培效益。隨著食用菌產(chǎn)業(yè)的大發(fā)展，菌種的生產(chǎn)量不斷擴大，由于菌種污染而造成的經(jīng)濟損失也在成倍地增加，這已成為食用菌發(fā)展不可忽視的問題。從菌種生產(chǎn)的各個環(huán)節(jié)入手，客觀地分析造成污染的原因，采取相應(yīng)的預(yù)防措施，才能達(dá)到降低制種成本，提高菌種質(zhì)量和產(chǎn)量的目的。
　　
　　減少菌種污染可以采取以下措施：
　　
　　一、安排時節(jié)。在夏季潮濕環(huán)境中，若溫度適宜，雜菌滋生蔓延快，而每年的7～8月份是制作蘑菇原種、栽培種的適宜季節(jié)，但此期各地普遍高溫多雨，雜菌非常活躍，也是菌種受污染最嚴(yán)重的時期。高溫季節(jié)，食用菌的接菌時間提前或延后，是降低雜菌污染的一條經(jīng)濟有效的途徑。具體做法是在7～8月份的氣溫較低的時間段接菌，如早晨或晚上。當(dāng)然，如果在有空調(diào)的室內(nèi)接菌效果更佳。
　　
　　二、配培養(yǎng)料。用于制作原種、栽培種的培養(yǎng)料，原料要新鮮，成團、結(jié)塊的料要打碎，難吸水的培養(yǎng)料應(yīng)先用足夠的水拌濕，然后充分拌勻。培養(yǎng)料中拌入0.1%～0.2%的多菌靈可濕性粉劑，可抑制木霉和青霉的生長。用常壓滅菌，拌料后要及時裝瓶(袋)，上鍋滅菌，擱置時間不宜超過5小時。
　　
　　三、細(xì)心裝料。根據(jù)培養(yǎng)料性質(zhì)、培養(yǎng)時間、滅菌方法等，選用合適的瓶或袋，培養(yǎng)料裝至離棉塞2～3厘米處，抹凈瓶(袋)口，然后加棉塞，以免水分和培養(yǎng)料沾污。制作母種注入培養(yǎng)基時要細(xì)心，切勿將培養(yǎng)基沾在試管口上。加棉塞要松緊適中，若過松容易進(jìn)入雜菌。
　　
　　四、徹底滅菌。在滅菌鍋內(nèi)，試管要豎放，瓶(袋)擺放要留空隙，棉塞不能相互擠壓。根據(jù)培養(yǎng)料和容器裝置，確定滅菌蒸汽壓力(或溫度)和滅菌時間，注意排冷空氣，而且放氣速度要慢。
　　
　　五、無菌操作。每個操作環(huán)節(jié)都要嚴(yán)格按無菌操作規(guī)程進(jìn)行，進(jìn)入接種室后要少走動、少說話。料袋滅菌后冷卻至不燙手時搬動，可減少袋壁破裂，接種環(huán)境清潔，接種室(箱)要密封和嚴(yán)格消毒。接種用具保持清潔，用前消毒處理，棉塞潮濕應(yīng)更換滅菌過的干燥棉塞。
　　
　　六、選健壯菌。選用無污染、菌絲生長健壯的適齡母種和原種，接種前認(rèn)真檢查，并且不要用表層菌種接種。接種時最好破開瓶底，從下部接至表面2～3厘米處。若以瓶口取種，應(yīng)把上層2～3厘米的菌種挖掉，然后接種。
　　
　　七、清潔干燥。培養(yǎng)室要通風(fēng)干燥，啟用前清掃、消毒。培養(yǎng)菌種期間，每天要適當(dāng)通風(fēng)。當(dāng)空氣濕度大于70%時，要用吸濕機、空調(diào)機或用生石灰、木炭等降低室內(nèi)濕度。
　　
　　八、定期檢查。接種后5～7天檢查一次。污染雜菌的，要及時揀出處理，并且分析原因，加以控制。搬動培養(yǎng)瓶(袋)要小心輕放。預(yù)防老鼠、蟑螂等為害帶入雜菌。